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TOM-酰胺在RNA合成中的亮点:1,2
ChemGenes 根据GMP准则生产2' - O-三异丙基甲硅烷基-氧基甲基(TOM)酰胺。ChemGenes拥有完善的技术,可以以优惠的价格生产大量(千克级批次)TOM酰胺。
TOM酰胺非常适合大规模治疗级RNA合成,长RNA序列,适体,siRNA和生物学上重要的RNA分子。
以下品质使TOM酰胺成为治疗性寡核苷酸生产的理想选择。
像DNA酰胺一样,TOM酰胺具有更高的偶联效率。观察到的每步耦合效率始终> 98%。
较高的耦合效率归因于TOM组的较低位阻。
快速的偶联时间(对于不同规模的合成,需要2-4分钟),并且*没有3'杂质。
N保护基团的脱保护时间短,取决于链长和大量的水,时间为4-6小时。
使用的不稳定的碱保护基是(N -Ac-A;N -Ac-C和N -Ac-G)。
在温和条件下和大量过量的水中可轻松去除TOM保护基,而*。
对使用TOM酰胺合成的寡核苷酸质量的研究表明,使用TOM酰胺合成的RNA寡核苷酸经过单次离子交换纯化并通过CE(图1)和ESI / MS分析进行分析后,其质量远远优于其他寡核苷酸。
使用TOM酰胺化学法可整体上减少时间。所有步骤,即。,碱基脱保护,TOM脱保护和易于纯化。除了高产率之外,该方法还导致高纯度。
图1:使用2'- O- TOM酰胺的HPLC纯化的12-mer RNA(12μmol 规模)的毛细管凝胶电泳(CE)。
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确认没有甲醛加合物形成的研究:
在甲硅烷基的损失和甲醛的产生期间,不会导致核苷碱基的C-5甲酰化或N-甲酰化。这是由于存在aq。TRIS缓冲液(pH 7.4),可捕获所有产生的甲醛并防止任何碱修饰(方案1)。从ESI / MS分析光谱数据可以明显看出这些结果。质谱数据均未显示对应于羟甲基加合物(CH2-OH)的任何峰,无论是单个单元(M + 30)还是多个M + 30单元(图2a和图2b)。这些结果说明了使用TOM酰胺的清洁RNA合成。
方案1: TOM脱保护和捕获甲醛的示意图。
图2: ESI MS分析确认没有M + 30或M + 30加合物的倍数;目标MS为3715.3(实测值为3715.3)。
RNA合成:
RNA的重要性早已在细胞过程中得到认可。关注的主要领域是反义RNA 1和催化RNA在剪接和连接中的作用。2定义序列的化学合成RNA是开发和了解RNA的作用和应用的基础。使用RNA聚合酶的酶促方法是模板依赖性的,因此不是受控序列合成。3 RNA的化学合成已经完善到一定程度,可以有效地产生长序列,例如具有生物活性的76-mer tRNA和多毫克量。4
小干扰RNA:
自线虫秀丽隐杆线虫5的描述以来RNAi已成为一种功能强大且广泛使用的基因下调工具,Andrew Fire和Craig Mello荣获2006年诺贝尔医学奖,以表彰RNAi机制的发展。RNAi途径由称为Dicer的内源性核糖核酸酶启动,该酶将长dsRNA分子加工成21-23个核苷酸的长siRNA分子的短片段,两个核苷酸3'突出端。siRNA分子整合到RNA诱导的沉默复合体(RISC)中,两条siRNA链之一解开。在RISC中关联的单链反义分子序列选择性结合特定的mRNA转录物,并且来自该复合物的内切核酸酶切割目标mRNA。从近几年开始6
RNAi提供了在细胞水平上了解和处理人类疾病的天文潜力。在广阔且迅速发展的siRNA领域中,该领域的一些重要进展是对细胞生物学和功能基因组学领域的自然调控机制的预测。预期这将导致基于基因的药物发现。目前,*许多研究人员都极力主张进行基因控制,基因敲除和靶标验证。短dsRNA 通过化学合成获得。ChemGenes专业生产高纯度的RNA单体,用于该领域的研究和进一步开发。
乙硫基四唑(ETT)和苯硫基四唑(BMT)的用途:
已证明在合成中使用ETT或BTT作为激活剂可提高每个步骤的偶联效率。
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产品货号 产品名称 品牌 规格
Macosko-2011-10(V+) Barcoded microparticles Chemgenes 10umol
DMT-1972 Extra large Drying Traps ChemGenes pack 10
DMT-1973 Large Drying Traps ChemGenes pack 10
"DMT-1975" Small Drying Traps ChemGenes pack 10
N-4000-03 "Universal UnyLinker Support ChemGenes
N-4000-05 Universal UnyLinker Support 500 ChemGenes 1g
N-4000-20 Universal UnyLinker Support 2000 ChemGenes 1g
N-4000-10 Universal UnyLinker Support 1000 ChemGenes 1g
DN-1597 chemgenes 100mg
DN-6493 chemgenes 100mg